Facturation électronique : ce qui change pour les infirmiers libéraux depuis le 1er septembre 2026
Orion Santé

Depuis le 1er septembre 2026, toutes les entreprises établies en France doivent être en mesure de recevoir des factures électroniques, quelle que soit leur taille. Le ministère de l'Économie précise que les indépendants et les professions libérales sont concernés, qu'ils facturent ou non la TVA (economie.gouv.fr).
Selon impots.gouv.fr, cette obligation de réception s'applique dès lors que le fournisseur a l'obligation d'émettre ses factures sous forme électronique. Cet article fait le point, sources officielles à l'appui, sur le calendrier de la réforme, le cas des soins exonérés de TVA et les outils mis à disposition par l'administration.
À retenir
• 1er septembre 2026 : obligation de réception des factures électroniques pour toutes les entreprises, professions libérales comprises.
• 1er septembre 2027 : obligation d'émission pour les PME et les micro-entreprises.
• Les opérations exonérées de TVA ne sont pas soumises à la facturation électronique. Les soins dispensés par les professions paramédicales réglementées sont exonérés de TVA.
• Une plateforme agréée par l'administration est l'intermédiaire obligatoire pour recevoir et émettre ces factures.
• Au démarrage, l'administration annonce une approche de tolérance envers les entreprises de bonne foi.
Qu'est-ce qu'une facture électronique au sens de la réforme ?
Une facture électronique n'est pas un simple PDF envoyé par e-mail. Selon le ministère de l'Économie, elle doit respecter une forme électronique normée, comporter les mentions obligatoires dans des champs dédiés et être transmise par l'intermédiaire d'une plateforme agréée. Une facture papier scannée, un PDF ordinaire ou un document envoyé par mail ne sont plus conformes à la réglementation dans le cadre de la réforme (economie.gouv.fr).
Deux notions sont à distinguer :
• La plateforme agréée : un prestataire de dématérialisation de factures immatriculé par l'administration fiscale. C'est l'intermédiaire obligatoire entre entreprises pour l'envoi et la réception des factures électroniques.
• La solution compatible : un logiciel (comptabilité, facturation, logiciel métier) qui aide à se mettre en conformité mais qui n'est pas immatriculé. Il doit obligatoirement passer par une plateforme agréée pour transmettre les factures.
Au 11 juillet 2026, le ministère de l'Action et des Comptes publics indiquait que 2 millions d'entreprises avaient déclaré disposer d'une plateforme agréée de réception, parmi 130 plateformes répertoriées (communiqué de presse du 11 juillet 2026).
Un infirmier libéral est-il concerné par la facturation électronique ?
Oui, pour la réception des factures, depuis le 1er septembre 2026. Le ministère de l'Économie indique que toutes les entreprises, indépendants et professions libérales assujettis à la TVA sont concernés, quels que soient leur taille, leur chiffre d'affaires ou leur régime d'imposition. Il ajoute que même une entreprise qui n'émet pas de facture doit pouvoir recevoir des factures électroniques de ses fournisseurs.
Émission de factures : le cas des soins exonérés de TVA
Le ministère de l'Économie précise que les opérations bénéficiant d'une exonération de TVA ne sont pas soumises à la facturation électronique (economie.gouv.fr, rubrique « Vos principales questions »).
Or l'article 261, 4, 1° du Code général des impôts exonère de TVA les soins dispensés aux personnes par les membres des professions médicales et paramédicales réglementées (article 261 du CGI sur Légifrance). La doctrine fiscale précise que cette exonération vise les prestations de soins à la personne, c'est-à-dire celles qui concourent au diagnostic ou au traitement des maladies (BOFiP, BOI-TVA-CHAMP-30-10-20-10).
Calendrier de la facturation électronique : les dates clés
La réforme se déploie en deux étapes, selon la taille des entreprises. Les dates ci-dessous sont celles publiées par l'administration (impots.gouv.fr).
11 juillet 2026
Publication du guide pratique de la DGFiP et annonce d'une approche de tolérance pour la phase de démarrage.
1er septembre 2026
Toutes les entreprises doivent pouvoir recevoir des factures électroniques. Les grandes entreprises et les entreprises de taille intermédiaire (ETI) doivent en outre les émettre et transmettre leurs données de transaction et de paiement à l'administration.
1er septembre 2027
Les PME et les micro-entreprises doivent à leur tour émettre leurs factures électroniques et transmettre leurs données de transaction et de paiement à l'administration.
Pour la phase de démarrage, le ministre de l'Action et des Comptes publics a annoncé qu'il n'y aurait pas de sanctions pour les entreprises de bonne foi rencontrant une difficulté et engageant le travail nécessaire pour régulariser leur situation (ministère de l'Action et des Comptes publics).
Ce qui change et ce qui ne change pas pour votre cabinet
La réforme modifie le processus de transmission des factures, mais le ministère de l'Économie précise que les modalités de facturation restent identiques.
Ce qui change
• Les factures électroniques de vos fournisseurs arrivent par une plateforme agréée.
• Une facture PDF ordinaire envoyée par e-mail n'est plus conforme dans le cadre de la réforme.
• Les factures reçues sont centralisées sur votre plateforme, avec notification et suivi de leur statut.
• De nouvelles mentions obligatoires apparaissent sur les factures électroniques émises : numéro Siren du client, catégorie de l'opération, option pour le paiement de la TVA d'après les débits le cas échéant, adresse de livraison si elle diffère de l'adresse de facturation.
Ce qui ne change pas
• Les modalités de facturation restent identiques : seul le canal de transmission évolue.
• L'exonération de TVA des soins dispensés par les professions paramédicales réglementées, prévue à l'article 261, 4, 1° du CGI.
• Pour les PME et micro-entreprises, l'obligation d'émission ne s'applique pas avant le 1er septembre 2027.
Sources : economie.gouv.fr ; Service Public Entreprendre ; Légifrance.
Comment se mettre en conformité en pratique ?
L'administration met à disposition plusieurs outils pour vérifier ses obligations et choisir sa solution. Voici les démarches qu'elle propose.
• Vérifier vos obligations grâce au questionnaire en 4 questions d'impots.gouv.fr.
• Interroger l'éditeur de votre logiciel de gestion ou de comptabilité : s'il s'agit d'une solution compatible, il doit pouvoir s'appuyer sur une plateforme agréée.
• Choisir une plateforme agréée dans la liste officielle des plateformes agréées, régulièrement mise à jour par l'administration fiscale.
• Consulter le guide pratique de démarrage de la DGFiP, qui répond aux situations concrètes : facture qui ne passe pas par le circuit attendu, plateforme indisponible, difficulté chez un prestataire.
En pratique
Une question sur la réforme ? La DGFiP a ouvert une assistance téléphonique dédiée au 0806 807 807, du lundi au vendredi de 8h30 à 18h. Le ministère de l'Économie cite également l'éditeur de votre logiciel de gestion ou de facturation parmi les interlocuteurs possibles.
Gestion du cabinet et facturation : se former avec Orion Santé
Autre évolution de 2026 pour la facturation des IDEL : l'avenant 11 prévoit une revalorisation de la lettre clé AMI en deux étapes, dont une première hausse de 20 centimes dès novembre 2026 (communiqué de l'Assurance Maladie).
Orion Santé, créé en 2003 à l'initiative de deux infirmiers libéraux, consacre un dossier à la gestion du cabinet infirmier libéral, avec une formation dédiée aux compétences de gestion administrative, financière et numérique. Orion Santé propose également une formation NGAP sur la cotation, la nomenclature et la facturation.
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Sources
• Ministère de l'Économie : Tout savoir sur la facturation électronique pour les entreprises
• impots.gouv.fr : À partir de quand suis-je concerné par la réforme de la facturation électronique ?
• DGFiP : Guide pratique de démarrage au 1er septembre 2026
• impots.gouv.fr : Liste des plateformes agréées
• Ministère de l'Action et des Comptes publics : communiqué de presse n° 898 du 11 juillet 2026
• Service Public Entreprendre : Facturation électronique, calendrier et nouvelles mentions
• Légifrance : Code général des impôts, article 261 (opérations exonérées)
• BOFiP : TVA, exonération des professions médicales et paramédicales
• Assurance Maladie : communiqué du 31 mars 2026 sur l'avenant 11